①疏松肥沃、排水良好、富含有机质的土壤，因为有机质具有稳定土壤团粒结构，可以缓慢释放养分，有利黄连的生长。黄连的根茎浅，大部分都在5-10厘米的土层中，因此适宜生长在上层为腐殖质肥厚的沙壤土、下层为保水保肥较强的壤土或黏壤上中（俗称“上泡下实”）。反之，土质不好、山顶或洼地排水不好的地方不宜种植。
②土壤酸性不宜过重。
③黄连不适宜于连作。因为连作导致土质不好且土壤病害发生严重。种过黄连的土地需要经过2-3年轮作后，才可继续栽培黄连。同时污染的土壤也不能种黄连。
④植被以杂木、油竹等混交林为好，不宜选土壤瘠薄的松、杉林种黄连。
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