犊牛发生肺炎的病因是受到多种因素影响的，肺炎的发生和犊牛呼吸器官的发育不全、器官功能不完善有直接的关系。生产实践表明，犊牛肺炎的发病原因主要有以下几个方面：
(1)病从口入
给犊牛饲喂长期放置于牛舍的抗奶，这些奶因为长期的放置，早已被污染，含有大量有害菌，也包括会使犊牛发生肺炎的病菌。
犊牛长期喝这些抗奶，肺部就会受到感染，因为犊牛治疗时使用的抗生素与抗奶中抗生素相同，所以，病原体对抗生素会产生耐药性，给犊牛肺炎治疗带来不利的影响，犊牛很难治愈，导致病情被延误。
(2)高温日射
炎热夏季，犊牛个体小，神经、器官发育并不健全，体温的调节能力上较差。一般犊牛适宜温度是10～20℃，气温超过了27℃，犊牛就会发生热应激反应。热应激反应会使犊牛免疫力下降，出现中暑症状，由于高热而激发成肺炎。
很多养殖户都没有做好防暑降温的工作，没有认真观察犊牛，使犊牛得不到有效的治疗，导致犊牛肺炎高发以致死亡。
(3)环境不良
温度过低或者温差过大的环境，都会使犊牛由于冷热交替的原因而发病。尤其在北方地区，气温变化大，冬季的圈舍过于阴冷和潮湿，一般温度在8℃以下，湿度在75%以上，容易使犊牛患流感，如果没有及时诊治，则会诱发肺炎。
犊牛如果淋雨或者被冷风侵袭后，都会使其的抵抗力下降，引发风寒继发肺炎。
(4)多种致病原
犊牛肺炎不是由单一致病原形成的，是由多种致病原所引发，包括病毒、细菌及巴氏杆菌等病原。犊牛由于细菌性感染，也会出现发热而继发肺炎。
在实践工作中发现，犊牛腹泻继发肺炎的概率是没有腹泻犊牛的3倍。可见，使用单一抗生素是不能将所有致病原消除的，这也使犊牛肺炎不能取得最佳的治疗效果。
